在离婚后，两个孩子的分配问题主要遵循“最有利于未成年子女”的原则。具体分配方式会因孩子的年龄和具体情况有所不同。

首先，对于不满两周岁的子女，一般来说，他们会由母亲直接抚养。这是因为在这个年龄段，孩子们更需要母亲的照顾和哺乳。然而，如果母亲存在严重疾病等特殊情况，无法或不愿抚养孩子，那么也可以由父亲来抚养。

其次，对于已满两周岁的子女，法院会综合考虑父母双方的抚养能力和条件，如经济状况、教育水平、生活环境等，然后做出判决。通常情况下，法院会判决给能提供更好环境的一方来抚养孩子。但也有可能判决父母双方各自抚养一个孩子，以保持平衡。

此外，如果孩子已经满八周岁，那么法院会尊重他们的真实意愿，看他们更愿意随哪一方生活。这是因为在这个年龄段，孩子们已经有了一定的自主意识和判断能力。

除了孩子的抚养权问题，离婚还涉及到财产的分割。一般来说，夫妻在婚姻关系存续期间所得的财产属于共同财产，应该进行平分。如果一方负责抚养孩子，那么另一方就需要支付抚养费，以确保孩子们的正常生活和教育需求得到满足。

总的来说，离婚后两个孩子的分配问题是一个复杂而敏感的问题，需要综合考虑多方面的因素。最重要的是要以孩子的利益为优先考虑，确保他们能够在健康、安全、有爱的环境中成长。