当三者险的被保险车辆非车主本人驾驶且发生交通事故时，保险公司的理赔主要依据的是保险合同的约定以及相关法律法规，而不是单纯地看驾驶员是否为车主。以下是关于此问题的详细解答：
一、理赔情况说明
一般情况下能理赔：
- 当车主与驾驶员之间存在合法的租赁、借用关系，或者驾驶员是受雇于车主进行驾驶工作时，若发生交通事故，保险公司通常会在其责任限额内作出合理的理赔。
- 理赔的具体金额和比例会根据保险合同的约定以及事故的实际情况来确定。
特殊情况下可能不理赔：
- 若车辆在被盗窃期间发生交通事故，根据相关法律规定，应由盗窃人承担事故的赔偿责任，车主无需承担赔偿责任，同时交强险及商业车险亦不予理赔。
- 若在转让报废车辆或拼装车期间发生交通事故，转让方与受让方均需承担赔偿责任，且交强险及商业车险同样无法提供理赔服务。
二、责任划分
驾驶员责任：
- 若交通事故系由驾驶员操作不当导致，驾驶员需承担相应的事故责任。
- 若驾驶员存在无证驾驶、酒驾或醉驾、肇事逃逸等违法行为，将依法承担更严重的责任。
车主责任：
- 车主虽未直接驾驶，但需对车辆的管理和使用负责。
- 若车主在事故中亦存在过失行为，如未对车辆进行必要的维护或保养，导致车辆存在安全隐患，车主则需依法律法规承担相应的赔偿责任。
三、处理建议
- 及时报案：发生交通事故后，应第一时间向保险公司和交警部门报案，以便进行事故认定和理赔处理。
- 保留证据：保留好事故现场的照片、视频等证据材料，以及医疗费用发票、维修费用清单等理赔所需的资料。
- 配合调查：积极配合保险公司和交警部门的调查工作，如实陈述事故经过和损失情况。
综上所述，当三者险的被保险车辆非车主本人驾驶且发生交通事故时，保险公司会根据保险合同的约定和相关法律法规进行理赔。同时，车主和驾驶员也需明确各自的责任与义务，确保合法驾驶和合理使用车辆。