对于个体工商户法人存入对公账户的账务处理，首先需要明确的是，个体工商户在经营过程中，应当按照相关法律、行政法规以及《个体工商户建账管理暂行办法》的规定来设置、使用和保管账簿及凭证，并根据合法、有效凭证进行记账核算。

当个体工商户法人将款项存入对公账户时，这一交易应当作为财务活动被记录下来。具体的账务处理步骤可能因个体工商户的会计制度（复式账或简易账）而有所不同，但一般应遵循以下原则：

一、复式账的账务处理

对于设置复式账的个体工商户：

1. 记录存款交易：在银行存款日记账中，记录存入对公账户的款项，包括日期、金额、来源等详细信息。
2. 更新总分类账：根据银行存款日记账的记录，更新总分类账中的银行存款科目，以反映账户余额的变化。
3. 核对与报表：定期核对银行存款日记账与银行对账单，确保记录准确无误，并在需要时编制财务报表，如资产负债表、利润表等，以反映个体工商户的财务状况和经营成果。

二、简易账的账务处理

对于设置简易账的个体工商户：

1. 记录收入：如果存入对公账户的款项被视为经营收入，则应在经营收入账中记录该笔款项。
2. 更新经营费用账（如适用）：如果存款与某项经营费用相关，可能需要在经营费用账中进行相应记录。
3. 库存与利润：根据经营收入和费用的记录，定期更新库存商品（材料）盘点表和利润表，以反映个体工商户的盈利情况。

三、注意事项

1. 合法凭证：确保所有交易都有合法、有效的凭证作为记账依据。
2. 及时记账：交易发生后应及时记账，避免遗漏或延误。
3. 定期核对：定期核对账簿与实际交易情况，确保账实相符。
4. 税务申报：根据税务机关的要求，按时进行税务申报，并报送相关财务报表和纳税资料。

综上所述，个体工商户法人存入对公账户的账务处理需要根据个体工商户的会计制度（复式账或简易账）进行具体操作，但都应遵循合法、准确、及时的原则，并确保所有交易都有合法凭证作为依据。同时，个体工商户还应按照税务机关的要求进行税务申报和报表报送。