关于个体户用个人卡打款给公司后能否开发票的问题，这主要取决于交易的性质、真实性以及是否遵守了相关的税法规定。以下是对这一问题的详细解答：
可以开具发票的情况
交易真实性：
- 确保双方之间存在真实的业务往来，这是开具发票的前提条件。无论是购买商品还是接受服务，交易必须是真实发生的。
应税行为：
- 如果个体户向公司支付的款项属于应税的经营行为，如购买商品、接受服务等，并且公司具备开具发票的资格，那么公司应当为个体户开具发票。
提供开票信息：
- 个体户需要向公司提供准确的开票信息，包括个人姓名（或公司名称，如果以公司名义进行交易）、纳税人识别号（如有）、地址、电话等。这些信息将用于开具发票，并确保发票的准确性和合规性。
合规操作：
- 公司需确保发票的开具符合税法规定，不得虚开或开具与实际业务不符的发票。同时，个体户也需了解并遵守相关的税法规定，如是否需要缴税及如何税务申报。
不能开具发票的特殊情况
交易不合法：
- 如果款项对应的交易本身是违法的，如涉及走私、贩毒等非法活动，这种情况下不能开具发票。
无法确认业务真实性：
- 如果公司无法确认个体户打款的具体业务内容，或者个体户无法提供与业务相关的必要信息（如合同、订单等证明文件），公司可能会拒绝开具发票。
不符合税收征管规定：
- 如果个体户要求开具与实际业务不符的发票，如虚开发票，公司不能满足这种不合理要求。虚开发票是严重的违法行为，会面临税务机关的严厉处罚。
总结与建议
- 在进行交易前，双方应明确交易的性质和细节，并确保交易的真实性和合规性。
- 个体户应提供准确的开票信息给公司，以便公司能够开具合规的发票。
- 如果对开票流程或税法规定有疑问，建议咨询专业的税务机构或会计师以获取更准确的指导。
- 双方都应妥善保管发票和相关凭证，以备后续使用或税务机关查验。
综上所述，个体户用个人卡打款给公司后能否开发票，需根据交易的真实性、应税行为以及是否遵守税法规定来判断。在符合相关条件的情况下，公司是可以为个体户开具发票的。