针对“医保检查扣分怎么处理”的问题，以下是根据相关信息整理出的详细解答：
医保检查扣分是医保支付资格管理制度的一部分，该制度旨在通过“驾照式记分”的方式，对定点医药机构及相关责任人员的医保支付资格进行管理，以遏制医保基金的滥用。当定点医药机构或相关责任人员因违法或违反服务协议而被扣分时，将按照以下方式处理：
一、扣分档次与处罚措施
记分档次：
- 1至3分、4至6分、7至9分、10至12分，共四个档次。
处罚措施：
- 一个自然年度内记分达到9分的，将暂停其医保支付资格1至6个月，暂停期内提供服务发生的医保费用不予结算（急救、抢救除外）。
- 一个自然年度内记分达到12分的，将终止医保支付资格，终止期内所提供服务发生的医保费用将不予结算。其中，由于小的违规行为累计记满12分的，终止之日起1年内不得再次登记备案；一次性记满12分的，终止之日起3年内不得再次登记备案。
二、记分管理的实施与联动
实施方式：
- 各省级医疗保障部门将在三年内逐步将相关责任人员纳入记分管理，并确保平稳落地。
- 探索将相关人员医保支付资格管理纳入医疗保障信用管理体系。
联动机制：
- 一旦在一家定点医药机构被暂停或终止医保支付资格，在其他定点医药机构也将被采取相应措施。
- 在一个区域被记分处理的，信息会在全国共享，实现跨机构、跨区域联动。
三、其他相关措施
建立“一人一档”：
- 为定点医药机构相关人员建立医保诚信档案，全面记录其记分情况以及其他遵守医保相关法律法规的情况，伴随其整个职业生涯。
协同监管：
- 医保部门将把记分和暂停、终止人员有关情况通报卫健部门和药监部门，由其按照职责对相关人员进一步加强管理，共同形成监管合力。
综上所述，医保检查扣分是根据医保支付资格管理制度进行的，旨在通过记分和相应的处罚措施来规范定点医药机构及相关责任人员的行为，保障医保基金的安全和有效使用。对于被扣分的定点医药机构或相关责任人员，将根据其记分情况采取相应的处罚措施，并可能在全国范围内实现联动管理。