您好，如果增值税发票丢失了，税务查询及后续处理方式会根据发票的类型（纸质或电子）以及丢失的具体情况有所不同。以下是一些详细的指导：

纸质发票丢失

1. 同时丢失发票联和抵扣联：

   • 根据规定，您可以凭加盖销售方发票专用章的相应发票记账联复印件，作为增值税进项税额的抵扣凭证、退税凭证或记账凭证。

2. 丢失发票联或抵扣联：

   • 如果仅丢失发票联，您可以使用抵扣联的复印件作为记账凭证。
   • 如果仅丢失抵扣联，您可以使用发票联的复印件作为退税凭证或抵扣凭证。

3. 丢失记账联：

   • 对于增值税专用发票记账联的丢失，虽未做明确规定，但一般情况下，您可以使用发票联或抵扣联等其他联次的复印件作为记账凭证。同时，请确保丢失记账联一方保存好提供发票复印件一方的相关证明，证明要点包括与原件一致、加盖原件保存单位公章或个人签章。

4. 丢失普通发票的记账联或发票联：

   • 如果丢失普通发票的记账联，您需要取得发票联的复印件，并由提供发票联复印件的单位出具相关证明，证明上需注明与原件核对无误，并加盖原件保存单位公章或个人签章。
   • 如果丢失普通发票的发票联，根据《会计基础工作规范》的规定，您应当取得原开出单位盖有公章的证明，并注明原来凭证的号码、金额和内容等，由经办单位会计机构负责人、会计主管人员和单位领导人批准后，才能代作原始凭证。

5. 丢失机动车销售统一发票：

   • 参照丢失增值税专用发票的处理方式。

6. 丢失空白发票：

   • 您应当于发现丢失当日书面报告税务机关，并填报《发票挂失损毁报告表》。然后持税控设备到主管税务机关或自行办理电子发票退回或作废手续。

电子发票丢失

• 对于税控系统开具的电子发票，您可以联系销售方提供相关下载链接。
• 如果是通过增值税电子发票公共服务平台开具的增值税电子发票，您可以联系销售方提供发票下载链接，或者通过全国增值税发票查验平台输入发票相关信息进行查询和下载。

注意事项

• 自2019年7月24日起，发票丢失登报作废声明不再提交，即无需登报声明遗失。
• 纳税人丢失发票后，无需前往税务机关申请开具《丢失值税专用发票已报税证明单》。
• 发生发票丢失情形时，应当于发现丢失当日书面报告税务机关，并填写发票遗失、损毁报告。

最后，请务必注意，丢失发票或擅自损毁发票可能会面临税务机关的处罚，包括责令改正、罚款等。因此，建议您加强发票管理，避免发票丢失或损毁的情况发生。