您好，关于“夫妻不在一个户口上是否可以分别有宅基地”的问题，这需要根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细解答：

首先，我们需要明确“一户一宅”的原则。这一原则是指农村每户村民只能拥有一处宅基地，用于建设自住的房屋。这是为了合理利用土地资源，防止土地浪费，并确保农民的住房权益。而“户”的认定，原则上是根据公安部门管理的户籍来确定的。如果户口簿上登记的是一家人，那么该户口簿所登记的家庭就被视为一户。

针对您的情况，夫妻双方的户口不在一起，是否能有两份宅基地，我们可以分以下几种情况讨论：

1. 夫妻双方已经离婚3年以上且没有共同居住在原来共有的农房：

   • 在这种情况下，夫妻双方可以视作“分户”状态。没有宅基地的一方是有资格重新申请宅基地来建房居住的。

2. 未离婚，两人户口不在一起，但在同一个村子里：

   • 此时，尽管户口分开，但夫妻双方仍然只能视作“一户”。如果原有的宅基地面积已经达到了当地一户所能申请的上限，那么就不能再申请新的宅基地。反之，如果原来的宅基地面积很小，还余出很多的面积，并且符合当地的宅基地面积政策要求，那么原则上可以申请余下面积大小的新的宅基地并建房。

3. 未离婚，两人户口在不同的村子：

   • 在这种情况下，申请到宅基地的可能性相对较小。因为户口在另一个村子里的一方通常也不可能单独作为一户，并且很可能在原来所在地已经拥有宅基地。当然，如果该方户主等人员已经去世，那么作为继承人是可以继承该宅基地上的农房的。

综上所述，夫妻不在一个户口上是否能分别有宅基地，需要根据双方的婚姻状况、户口所在地以及原有的宅基地面积等多种因素来综合考虑。如果您有具体的申请需求，建议咨询当地的土地管理部门或村委会，以获取更准确的指导和帮助。