关于您提到的医保余额转移后金额不一样的问题，这主要是因为不同地区的医保政策有所差异，特别是在医保个人账户资金的转移接续方面。以您的情况为例，您之前在广州工作并缴纳了医保，个人账户余额有1万多。但当您转移到深圳工作后，通过广东政务服务网申请了医保关系的转移，却发现转移金额为0，深圳医保个人账户里只有您在深圳工作期间缴纳的金额。

对此，深圳市医疗保障局的答复是明确的：根据《广东省基本医疗保险关系省内转移接续暂行办法》第十四条规定，参保人员省内跨市转移职工医保关系的，个人账户资金可以跨市使用，但不进行划转、不提现。这意味着，您的广州医保个人账户余额并没有直接转移到深圳的医保个人账户中，而是仍然保留在广州，您可以在需要时跨市使用这部分资金。

因此，您在深圳的医保个人账户中看到的余额，只是您在深圳工作期间缴纳的医保费用。如果您需要在深圳使用广州的医保个人账户余额，可以了解相关的跨市使用政策，看是否符合条件并按照规定进行操作。

总的来说，医保余额转移后金额不一样的情况，主要是因为医保政策的地区差异和转移接续规定所导致的。建议您在转移医保关系前，详细了解相关政策和规定，以便做出合理的决策和安排。