大客车在高速公路上被扣6分的情况主要包括以下几种：

1. 驾驶载货汽车载物超过最大允许总质量百分之五十以上：如果大客车作为载货汽车，且载物超过了其最大允许总质量的百分之五十，那么将会被扣6分。

2. 驾驶机动车运输危险化学品，未经批准进入危险化学品运输车辆限制通行的区域：大客车如果用于运输危险化学品，且未经批准进入了限制危险化学品运输车辆通行的区域，同样会被扣6分。

3. 驾驶机动车不按交通信号灯指示通行：在高速公路上，如果大客车驾驶人不按照交通信号灯的指示通行，如闯红灯等，也将被扣6分。

此外，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》的相关规定，还有其他一些情况也可能导致大客车在高速公路上被扣6分，如：

• 驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速未达到百分之二十，或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十的（对于大客车而言，即超速但未达到一定程度）。
• 驾驶机动车载运爆炸物品、易燃易爆化学物品以及剧毒、放射性等危险物品，未按指定的时间、路线、速度行驶或者未悬挂警示标志并采取必要的安全措施的（这同样适用于运输危险化学品的大客车）。
• 驾驶机动车在高速公路或者城市快速路上违法占用应急车道行驶的（大客车如果违法占用应急车道，也将被扣6分）。

综上所述，大客车在高速公路上被扣6分的情况主要涉及超载、违规运输危险化学品、不按交通信号灯指示通行以及超速、违规占用应急车道等违法行为。驾驶人应严格遵守交通规则，确保行车安全，避免被扣分。