医学上认定不应当结婚的疾病主要包括以下几类：
指定传染病：这包括《传染病防治法》中规定的艾滋病、淋病、梅毒、麻风病等，以及医学上认为影响结婚和生育的其他传染病。这些疾病在传染期内，患者应当暂缓结婚。
严重遗传性疾病：这类疾病由于遗传因素先天形成，患者可能全部或者部分丧失自主生活能力，且后代再现风险高，医学上认为不宜生育。例如，某些遗传性疾病可能导致子女出现严重的健康问题，甚至危及生命。
有关精神病：这包括精神分裂症、躁狂抑郁型精神病以及其他重型精神病。这些疾病可能影响患者的认知、情感和行为，导致他们无法履行婚姻中的责任和义务。
此外，根据相关法律和司法解释，一方有严重的生殖器疾患，以致不能发生性行为的，也应属于医学上认为不应当结婚的疾病。
需要注意的是，这些疾病的认定和判断需要由专业的医疗机构和医生进行。如果一方患有上述疾病，应当在结婚登记前如实告知另一方，否则另一方有权向人民法院请求撤销婚姻。因此，在结婚前进行全面的医学检查，了解双方的健康状况，是非常必要的。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。