合作医疗通常不可以报销近视眼手术的费用。这是因为近视眼手术通常被视为一种因美容、矫形或生理缺陷而进行的治疗，这类治疗费用通常不在合作医疗的报销范围内。

根据相关规定，合作医疗不报销的医疗费用包括：

1. 未经批准在非定点医疗机构就诊发生的医疗费用；
2. 因自杀、自残（精神病除外）、打架、斗殴、酗酒、吸毒及其他犯罪或违反治安管理所致伤病的医疗费用；
3. 因交通事故、意外伤害、医疗事故等产生的医疗费用；
4. 因美容、矫形、生理缺陷等进行治疗产生的医疗费用。

近视眼手术往往被归类为第4点中的“因生理缺陷进行治疗”的范畴，因此不在报销之列。

另外，《社会保险法》第二十八条也明确规定，只有符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，才能从基本医疗保险基金中支付。而近视眼手术并不符合这些条件。

因此，如果您计划进行近视眼手术，建议您提前了解相关的费用情况，并考虑其他支付方式，如自费或使用商业医疗保险等。