土地纠纷备案流程可能因地区和具体情况而有所不同，但一般来说，可以参考以下流程来处理土地纠纷并进行备案：
一、明确纠纷性质和主体
首先，需要明确土地纠纷的性质和涉及的主体。土地纠纷可能包括土地使用权争议、土地边界不清、土地被侵占等问题。涉及的主体可能包括个人、单位或村集体经济组织等。
二、协商与调解
- 协商：在发现土地纠纷后，首先建议当事人之间进行友好协商，尝试通过沟通解决纠纷。
- 调解：如果协商无果，可以考虑寻求第三方调解，如当地村委会、乡（镇）政府或土地管理部门等，他们可能会提供调解服务，帮助双方达成和解。
三、申请裁决或备案
如果协商和调解均无法解决纠纷，当事人需要根据纠纷的性质和所在地的具体规定，选择适当的途径进行申请裁决或备案。
土地流转登记备案：
- 对于土地流转相关的纠纷，如村集体经济组织或经营主体与农户之间的土地流转协议问题，可以按照土地流转登记备案的流程进行办理。
- 具体步骤包括：签订正规土地流转协议，并携带相关材料（如土地流转协议、法人代表身份证、营业执照、土地承包经营权证复印件等）到镇服务中心进行备案。
- 办理时限通常为5个工作日内。
土地权属争议裁决：
- 对于土地权属争议，如个人之间、个人与单位之间、单位与单位之间的土地所有权或使用权争议，需要向当地的国土资源行政主管部门申请裁决。
- 申请时需要提供明确的请求处理对象、具体的处理请求和事实根据，并按照要求提交相关材料。
- 国土资源行政主管部门会进行调查和处理，并作出裁决决定。当事人对裁决决定不服的，可以在规定时间内向人民法院起诉。
四、执行与监督
- 执行：一旦裁决或备案完成，当事人需要按照裁决决定或备案要求履行相关义务，如支付补偿款、归还土地等。
- 监督：如果对裁决或备案结果有异议，或者发现对方未履行相关义务，可以向相关部门进行投诉或申请强制执行。
五、注意事项
- 在整个流程中，建议当事人保留好所有相关证据和文件，以便在需要时提供证明。
- 如果对法律程序或相关规定不熟悉，建议咨询专业律师或法律机构以获取帮助。
综上所述，土地纠纷备案流程需要根据纠纷的性质和所在地的具体规定来确定。在处理过程中，当事人应积极配合相关部门的调查和处理工作，并保留好相关证据和文件以维护自己的合法权益。