如果确权时发现土地少了，您可以按照以下步骤进行处理：

首先，请仔细核对您的土地相关资料和记录，比如土地承包合同、土地使用证明等，确认土地确权证上的信息与实际土地情况是否存在差异，排查是否是因登记错误或资料不完整导致的土地面积不符。

如果核对后发现确实存在差异，您应及时与当地的土地管理部门取得联系，向其详细说明情况，并提交相关证据材料，申请对土地面积进行重新测量和核实。在这一步，您要保持沟通顺畅，积极配合土地管理部门的工作。

若经过重新测量和核实，确认是土地确权证上的登记有误，土地管理部门会根据实际情况进行更正，并为您换发新的土地确权证。在此过程中，您需要提供必要的协助和信息，确保更正工作的顺利进行。

然而，如果土地面积减少并非由于登记错误，而是存在土地权属争议，那么您需要通过合法的途径来解决争议。您可以尝试与争议方进行协商，或者寻求当地人民调解委员会的调解。如果协商和调解均无法解决问题，您还可以向人民法院提起诉讼，通过法律程序来维护自己的合法权益。

总之，面对确权土地少了的情况，您应保持冷静，按照上述步骤逐一处理。同时，也要注意保留好所有相关证据和材料，以便在需要时提供证明。