当单位修改个税报表后需要退税时，在电子税务局的操作主要可以分为两个步骤：首先更正个税申报，然后申请退抵税。以下是详细的操作步骤：
一、更正个税申报
登录电子税务局，选择单位纳税人身份进入。
在主界面或菜单中找到并点击“我要办税”。
在弹出的菜单中，选择“税费申报及缴纳”，然后选择“更正申报”。
进入更正申报页面后，找到并点击“个税申报”相关的更正选项。
根据实际情况，选择需要更正的所得项目，并填写正确的数据。
完成数据填写后，点击“重新计算”以计算更正后的应补（退）税额。
确认无误后，点击“申报表报送”，再点击“发送申报”以完成更正申报。
二、申请退抵税
完成更正申报后，返回“我要办税”页面。
在弹出的菜单中，选择“一般退（抵）税管理”。
在退（抵）税管理页面中，选择“误收多缴退抵税”。
进入“误收多缴退抵税”页面后，系统会根据您的税务登记和申报征收情况，自动生成《退（抵）税申请表》。
请认真核对《退（抵）税申请表》中的内容。如表中内容无误，您可直接点击“提交”退税申请。
如内容有误，请按实际经营情况确认或更正申报数据后，再点击“提交”。
提交退税申请后，请耐心等待税务机关的审核和处理。您可以在电子税务局的“我要查询”或类似菜单中，查看退税申请的进度和结果。
需要注意的是，具体的操作步骤和菜单名称可能会因地区或电子税务局系统的不同而有所差异。如果在实际操作中遇到问题，建议咨询当地税务机关或电子税务局的客服人员以获取准确的帮助。