户口不在本地也可以交合作医疗。根据国家医保局的相关规定，已经取消了户籍限制，灵活就业人员持居住证即可在就业地或常住地参加基本医疗保险。这意味着，无论您的户口在哪里，只要您在就业地或常住地有居住证，就可以参加当地的医疗保险。

具体来说，如果您是灵活就业人员，没有与用人单位建立稳定劳动关系，您可以选择以个人身份参加职工医保，也可以选择参加城乡居民基本医疗保险。在参保过程中，您需要提交一些证明材料，如居住证等，然后按照当地的规定进行缴费即可。

此外，多个省会城市或首府已经放开了灵活就业人员基本医保参保的户籍限制，并通过线上线下多渠道提供参保服务。这样，您就可以更加方便快捷地参加医疗保险，并享受相应的医疗保障待遇。

总的来说，户口不在本地并不影响您参加合作医疗。只要您符合相关条件，并按照规定提交所需材料，就可以在就业地或常住地参加医疗保险，并享受相应的医疗待遇。