新农合在三甲医院门诊是可以报销的，但具体的报销比例和限额可能会根据地区和政策的不同而有所差异。

以山西省孝义市为例，2024年起，居民普通门诊统筹年度支付限额提高至300元，每次最高支付限额50元，每日最多报销支付一次。门诊统筹待遇不设起付标准，在定点基层医疗机构（如乡镇卫生院、社区卫生服务中心、村卫生室）发生的符合规定的普通门诊医疗费用，医保统筹基金会按照一定比例支付，如甲类项目60%、乙类项目50%。而在县城内二级及以下定点医疗机构（不包括基层医疗机构）发生的医疗费用，支付比例会略有降低。

对于更高级别的医疗机构，如三甲医院，虽然具体的报销比例可能不同于基层医疗机构，但根据多地城乡居民医保政策，门诊费用在一定条件下也是可以报销的。不过，由于三甲医院通常属于较高级别的医疗机构，其报销比例可能会相对较低。

此外，值得注意的是，不同省份和地区的医保政策可能存在差异。因此，为了获得最准确的信息，建议您咨询当地的医保部门或相关机构，以了解具体的报销政策和流程。

总的来说，新农合在三甲医院门诊是可以报销的，但具体的报销比例和限额需要根据当地的医保政策来确定。建议您在就医前咨询当地医保部门，以便更好地了解相关政策和流程。