对于户口不在一起的孩子，办理户口问题主要遵循随父随母落户自愿的政策。以下是详细的解答步骤：

首先，要明确的是，异地不能直接给孩子上户口，需要回到孩子父母任何一方的户籍所在地进行办理。

接下来，准备必要的材料：

1. 孩子的出生证明：这是办理户口的必备材料，证明孩子的出生情况和身份。
2. 父母的身份证：提供父母的身份证明，以确认与孩子的关系。
3. 户口簿：需要提供孩子父母任何一方的户口簿，作为落户的依据。
4. 结婚证：如果父母已婚，需要提供结婚证作为证明。

如果孩子的父母未婚或者存在其他特殊情况，如政策外生育、非婚生育等，还需要提供额外的材料：

• 对于非婚生育的情况，除了上述材料外，还需要提供非婚生育说明，并按照随父随母落户自愿的政策进行申请。如果申请随父落户，还需要提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明。
• 如果孩子未办理《出生医学证明》，则需要根据出生情况向相关机构申领。在助产机构内出生的，可以向该助产机构申领；在助产机构外出生的，则需要提供亲子鉴定证明，向拟落户地县级卫生计生行政部门委托机构申领。

最后，携带上述所有材料，前往孩子父母任何一方户籍所在地的派出所进行申请办理。派出所会根据提供的材料进行审核，并依法为孩子办理户口登记。

总的来说，户口不在一起的孩子户口问题，需要根据随父随母落户自愿的政策，准备必要的材料，并前往父母任何一方户籍所在地的派出所进行申请办理。如有特殊情况，还需提供额外的证明材料。