当您发现自己因非本人驾驶的机动车被扣分时，可以按照以下步骤进行处理：
一、核实违规事实
查询详细信息：首先，您需要通过交通管理部门的官方网站、手机APP（如12123APP）或亲自前往交管部门，查询具体的违章时间、地点、行为以及处罚情况，确保对违规事件有全面的了解。
了解相关法规：查阅当地的交通法规，了解该违规行为的具体处罚措施和可能的申诉途径，为后续处理提供法律依据。
二、准备相关证据
为了证明该违规行为并非您所为，您需要准备以下证据材料：
不在场证明：如出差证明、上班打卡记录、医院就诊记录等，能够证明您在违章发生时不在现场的证据。
实际驾驶人信息：如果知道实际驾驶人是谁，应获取其姓名、联系方式和驾驶证信息等，并鼓励其承认驾驶行为。
监控录像与行车记录仪：利用监控录像、行车记录仪视频等客观证据来证明实际驾驶情况。如果可能的话，调取违章发生时的监控录像。
证人证言：如有目击者或其他知情人士，可以请其提供书面证言，进一步证明您的清白。
三、与交管部门沟通
提交材料：携带机动车行驶证、您的驾驶证、身份证以及准备好的证据材料，前往交警大队或支队违法处理窗口，向工作人员说明情况并提交材料。
申请撤销或更正：向交管部门提出撤销或更正处罚的申请。工作人员会对您的材料进行审核，如果认为证据充分，会按照规定程序进行处理。
四、后续处理
关注处理结果：定期查询车辆的违章信息和扣分情况，及时了解交管部门的处理结果。如果申请被接受，扣分和处罚会被撤销或更正。
申请行政复议或诉讼：如果交管部门未予更正，您可以在规定时间内（一般为60日内）向上一级公安机关交通管理部门或同级人民政府申请行政复议，或在6个月内直接向人民法院提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
加强车辆管理：为了避免类似情况再次发生，建议您加强对车辆使用的管理，确保车辆不被他人未经授权使用。
五、注意事项
合法合规：在处理过程中，请务必确保所有手续合法合规，避免提供虚假材料或进行违规操作。
及时沟通：与交管部门保持及时沟通，了解处理进展和所需材料，以便尽快解决问题。
保护个人信息：在处理过程中，注意保护个人隐私和信息安全，避免泄露不必要的个人信息。
综上所述，处理非本人机动车被扣分的情况需要您耐心、细心地准备证据并与交管部门沟通。遵循上述步骤和建议，您将能够更有效地维护自己的合法权益。