每日滞纳金3%是否合法，需根据具体情况判定。
在一般民事合同关系中：若双方对滞纳金比例有明确的约定，且该约定不存在显失公平等导致合同可撤销的情形，那么通常是具有法律效力的，应按照约定执行。但需要注意的是，过高的滞纳金比例可能使违约方承担过重负担，有悖于合理的利益平衡机制。因此，在实际操作中，若滞纳金比例过高，可能会引发法律纠纷，并由司法机关根据具体事实和法律进行认定。
在特定法律领域或行政领域中：滞纳金的收取标准可能受到严格限制。例如，在税收征收管理中，税收滞纳金的加收率是按照法律规定执行的，并非每日3%。在这种情况下，如果滞纳金比例超过法定标准，那么该约定将是违法的。
结合法律规定和实际情况：根据《中华人民共和国民法典》等相关法律，当事人可以约定违约金或滞纳金，但约定的违约金或滞纳金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。因此，在判断每日滞纳金3%是否合法时，还需要考虑实际损失情况、合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等综合因素。
综上所述，每日滞纳金3%是否合法并没有一个绝对的答案，而是需要根据具体的法律关系、相关法律法规的具体规定以及是否存在显失公平等因素进行综合判断。如果你对滞纳金比例的合法性存疑，建议咨询专业律师或相关法律机构进行进一步了解和评估。