针对您提出的问题，即拆迁司法已经调解但女儿提起法院诉讼认为自己有份额，法院会如何判决，以下是我的分析：

首先，需要明确的是，法院在判决时会综合考虑多个因素，包括但不限于调解协议的内容、女儿的诉讼主张及其依据、相关法律法规以及案件的具体事实情况。

1. 调解协议的法律效力：

   • 调解协议一旦达成并具有法律效力，通常对双方当事人具有约束力。如果调解协议中明确规定了拆迁补偿的分配方式，且该协议不违反法律法规的强制性规定，法院在判决时会充分尊重调解协议的内容。

2. 女儿的诉讼主张及依据：

   • 女儿提起法院诉讼，必须提供充分的证据来支持其诉讼主张。这些证据可能包括但不限于房产证、土地使用权证、家庭财产分配协议、遗嘱等，以证明其对拆迁房屋享有合法权益。
   • 法院将依据女儿提供的证据，结合案件事实，对其诉讼主张进行审查。如果女儿能够证明其对拆迁房屋享有合法权益，且该权益在调解协议中未得到充分体现，法院可能会根据相关法律法规作出相应的判决。

3. 相关法律法规的适用：

   • 法院在判决时会严格遵循相关法律法规的规定。例如，《民法典》中关于物权、继承、合同等章节的规定，以及《国有土地上房屋征收与补偿条例》等关于拆迁补偿的法律法规。
   • 法院将依据这些法律法规，对案件进行全面审查，并作出公正、合法的判决。

4. 案件的具体事实情况：

   • 法院在判决时还会考虑案件的具体事实情况，包括拆迁房屋的历史沿革、家庭成员之间的关系、拆迁补偿的具体分配情况等。
   • 这些事实情况将作为法院判决的重要依据，帮助法院更全面地了解案件，并作出更加公正、合理的判决。

综上所述，法院在判决时会综合考虑调解协议的法律效力、女儿的诉讼主张及依据、相关法律法规的适用以及案件的具体事实情况。因此，无法直接预测法院会如何判决。但可以肯定的是，法院将依据相关法律法规和案件事实，作出公正、合法的判决。如果您或您的女儿对判决结果有异议，可以依法提起上诉或申请再审。