结论前置：在红绿灯路口，如果车辆已过停止线后红灯才亮起，继续通行通常不会被认定为闯红灯而扣分罚款。

详细分析：

在红绿灯路口的通行规则中，闯红灯的判定通常基于交通技术监控设备抓拍的三张照片：车辆未越过停止线时红灯已亮起、车辆越过停止线时红灯仍然亮起、以及车辆驶离路口时红灯依旧亮起。这三张照片构成了判定闯红灯的完整证据链。

然而，在你的情况中，车辆已经越过了停止线，随后红灯才亮起。根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第三十八条的规定，黄灯亮时，已越过停止线的车辆可以继续通行。由此可以推断，在绿灯亮时开始通行，走到一半变为红灯的情况下，由于车辆已经越过了停止线，因此可以继续通行，不被视为违反交通信号灯指示。

特殊情况及应对：

• 确保安全：虽然在这种情况下不会被认定为闯红灯，但驾驶者在通过路口时仍需确保安全通行，特别要注意观察其他方向的车辆和行人动态，避免发生交通事故。
• 防止其他违法行为：如果因在路口中间停留或不当行驶导致交通拥堵或引发交通事故，可能会面临妨碍交通秩序等其他交通违法行为的处罚。
• 保持警惕：驾驶者在行驶过程中应始终保持高度警惕，注意交通信号灯的变化，确保安全驾驶。

综上所述，车辆在红绿灯路口已过停止线后红灯亮起，继续通行通常不会被认定为闯红灯而受罚。但驾驶者仍需遵守交通规则，确保安全通行，并时刻保持警惕以预防可能发生的交通事故。