您好，车辆有违章是可以在“交管12123”APP上进行处理的，但处理范围有一定的限制。以下是可以在“交管12123”上处理的违章情况：
处理本人或非本人名下的机动车非现场违法行为：只要机动车已在“交管12123”APP上备案，无论是本人还是非本人的车辆，都可以处理其非现场违法行为。
处理特定罚款和记分的非现场违法行为：对于处警告或者200元以下，记分为6分（含）以下罚款的非现场违法行为，您可以在“交管12123”上进行处理。
非本人机动车处理限制：对于非本人名下的机动车，只允许处理备案日之前新发生的交通违法行为。
此外，如果您对非现场交通违法认定有异议，还可以通过“交管12123”APP提出消除申请。您需要选择申诉原因，填写具体申诉原因，并上传相关证据照片，然后点击“提交”即可完成申诉。之后，您可以查看审核进度，由违法地交管部门进行审核。
总的来说，“交管12123”APP为车主提供了便捷处理交通违章的渠道，但处理时仍需注意相关限制和条件。如有任何疑问或需要进一步帮助，请随时咨询当地交管部门或“交管12123”客服。