营业执照变更法人是一个涉及公司治理结构和法律合规的重要过程，需要注意以下几个关键问题：

一、法定代表人的任职资格

首先，必须确保新选任的法定代表人符合任职资格。根据新《公司法》及相关法规，以下人员不得担任法定代表人：

1. 无民事行为能力或者限制民事行为能力人；
2. 因贪污、贿赂、侵占财产、挪用财产或者破坏社会主义市场经济秩序，被判处刑罚，执行期满未超过五年，或者因犯罪被剥夺政治权利，执行期满未超过五年；
3. 担任破产清算的公司、企业的董事或者厂长、经理，对该公司、企业的破产负有个人责任的，自该公司、企业破产清算完结之日起未超过三年；
4. 担任因违法被吊销营业执照、责令关闭的公司、企业的法定代表人，并负有个人责任的，自该公司、企业被吊销营业执照之日起未超过三年；
5. 个人所负数额较大的债务到期未清偿，被人民法院列为失信被执行人。

二、变更法定代表人的决议机关

变更法定代表人需要通过公司决议，但具体是由股东会还是董事会决议，需根据公司章程来确定：

1. 如果公司章程有规定：应按照公司章程规定的程序进行。
2. 如果公司章程未规定：
   • 如果新法定代表人的人选在原董事范围之内，或者选举新任经理，则董事会有权决议。
   • 如果新法定代表人的人选不在原董事范围之内，涉及董事人选变更，则应由股东会决议。

三、变更登记申请书的签署

新《公司法》规定，公司变更法定代表人的，《变更登记申请书》应由变更后的法定代表人签署。这一规定解决了原法定代表人不配合签署导致变更登记无法完成的问题。但同时，也应注意防止部分股东恶意或非法变更登记，如果发现此类情况，应及时向公司登记机关提出书面异议或向人民法院提起诉讼。

四、及时更新公司章程及相关文件

变更法定代表人后，应及时更新公司章程、股东名册、公司登记信息等，确保公司治理结构的合法性和合规性。同时，还需注意与公司业务相关的合同、协议等文件中法定代表人的信息更新。

五、注意税务和银行账户的变更

法定代表人变更后，还需及时通知税务机关和银行等相关机构，进行税务登记和银行账户的变更，确保公司财务和税务的合规性。

综上所述，营业执照变更法人是一个涉及多个方面的复杂过程，需要公司严格按照法律法规和公司章程的规定进行操作，确保变更过程的合法性和合规性。同时，也应注意防范可能出现的风险和纠纷，维护公司的稳定和发展。