行政机关工作人员职务犯罪的处理，主要遵循以下几个方面的原则和程序：
法律适用：行政机关工作人员职务犯罪，首先会依据《中华人民共和国刑法》的相关规定进行处理。根据犯罪的具体性质、情节和后果，可能会涉及贪污贿赂罪、滥用职权罪、玩忽职守罪等罪名。
调查程序：这类案件通常由检察机关或监察机关负责调查。调查过程中，会收集证据，查明事实，并依法对涉案人员进行讯问、取证等。
法律责任：一旦犯罪事实清楚，证据确实充分，涉案人员将面临法律责任。这可能包括刑事处罚，如有期徒刑、拘役、罚金等，以及可能的行政处分，如开除公职、降级、撤职等。
纪律处分：除了法律责任外，行政机关工作人员还可能受到党内或行政内的纪律处分。这取决于其党员身份或公职身份，以及违纪行为的性质和严重程度。
预防与教育：处理职务犯罪的同时，也应注重预防和教育。通过加强制度建设、监督管理和廉政教育，提高行政机关工作人员的法制观念和职业道德水平，减少职务犯罪的发生。
综上所述，行政机关工作人员职务犯罪的处理是一个综合的过程，涉及法律、纪律、预防和教育等多个方面。如果你有具体的法律问题或需要进一步的咨询，请直接向我提问。