关于货车未申请通行证如何处罚的问题，这主要涉及到公路运输管理的相关法规。以下是对此问题的详细解答：
首先，我们需要明确的是，货车在运输过程中，特别是涉及到超限运输时，必须按照相关规定申请并携带有效的通行证。这是为了确保道路运输的安全和顺畅，以及保护公路设施不受损害。
对于未申请通行证的货车，根据《公路安全保护条例》及《超限运输车辆行驶公路管理规定》的相关规定，将会受到以下处罚：
责令改正：公路管理机构或者公安机关交通管理部门在发现货车未携带通行证或未按指定时间、路线和速度行驶时，会首先责令其改正违法行为。
扣留车辆：如果货车驾驶人拒不改正，或者无法提供有效的通行证或相应的证明，公路管理机构有权扣留车辆，直至驾驶人提供有效的通行证或证明文件。
罚款：对于租借、转让超限运输车辆通行证的行为，公路管理机构将没收通行证，并处以1000元以上5000元以下的罚款。对于使用伪造、变造的超限运输车辆通行证的行为，罚款金额可能更高，甚至可能达到3万元以下。
此外，还需要注意的是，货车超限运输不仅可能面临上述行政处罚，还可能对公路设施造成损害，需要承担相应的赔偿责任。因此，货车驾驶人在进行运输前，务必确保已经按照相关规定申请了通行证，并严格按照指定的时间、路线和速度行驶。
综上所述，货车未申请通行证将可能面临责令改正、扣留车辆以及罚款等处罚措施。为了避免不必要的麻烦和损失，建议货车驾驶人在进行运输前务必了解并遵守相关的道路运输法规。