银行存单被法院冻结进行财产保全，并不意味着一定会被划扣。具体分析如下：

1. 冻结的目的与意义：

   • 法院对银行存单进行冻结，主要是为了保障诉讼或执行程序的顺利进行，防止当事人转移、隐匿财产。
   • 冻结是一种临时的保全措施，旨在确保在判决或裁定生效后，有足够的财产可供执行。

2. 划扣的条件与程序：

   • 划扣通常发生在判决或裁定生效后，且债务人未主动履行债务的情况下。
   • 法院会根据生效的法律文书，向银行发出协助执行通知书，要求银行将冻结的款项划扣至法院指定账户。

3. 冻结期间的处理：

   • 在冻结期间，被冻结的银行存单不能随意支取或转移。
   • 如果当事人对冻结有异议，可以向法院提出复议申请，要求解除冻结。

4. 可能的其他情况：

   • 如果案件最终未判决或裁定债务人需承担付款责任，或者债务人提供了其他足额的担保，法院可能会解除对银行存单的冻结。
   • 如果冻结的银行存单涉及其他法律纠纷或争议，可能需要通过进一步的法律程序来确定其归属和处理方式。

综上所述，银行存单被法院冻结进行财产保全，并不直接等同于会被划扣。具体是否会被划扣，取决于案件的后续进展和法院的判决或裁定。如果你对此有进一步的疑问或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。