关于灵活就业激活后是否能自动缴费的问题，这主要取决于当地的社保缴费系统和银行代扣系统的设置。以深圳市为例，个人灵活就业参保的缴费方式并非完全自动，而是需要个人进行一定的操作或确认。

首先，要确保你的社保金融卡处于可用状态，且卡内留有足够的余额以支付社保费用。这是自动扣费的前提条件。然而，即使这些条件都满足，也不代表系统一定会自动扣费。因为社保缴费系统可能需要你进行某些申报或确认操作，比如提交缴费申报、选择缴费档次等。

如果你已经完成了所有必要的申报和确认操作，但系统仍未自动扣费，那么可能是以下几种情况之一：

1. 缴费系统出现故障或延迟，导致未能及时扣费。
2. 你的社保金融卡或银行账户存在问题，比如账户被冻结、信息不匹配等，导致系统无法扣费。
3. 你可能未在规定的时间内完成缴费申报或确认操作，导致系统错过了扣费时间。

在这种情况下，建议你通过当地社保局的官方网站、客服热线或窗口咨询，了解具体的缴费情况和原因。如果确实是系统问题或银行问题导致的无法自动扣费，你可以按照工作人员的指导进行手动缴费或等待问题解决后再进行缴费。

总的来说，灵活就业激活后并不能完全保证自动缴费，而是需要个人关注缴费情况并按时进行操作和确认。如果你对缴费流程或操作有任何疑问，建议及时咨询当地社保局以获取准确的帮助和指导。