当您在注销公司营业执照的过程中遇到税务异议时，可以按照以下步骤进行处理：

一、明确异议内容与提出主体

首先，您需要仔细查看税务异议的具体内容，了解是哪方面的税务问题导致了异议。同时，确认异议是由税务机关还是其他相关利益主体提出的，因为不同主体的关注点和诉求可能不同。

二、核实税务问题并补缴税款

针对税务异议，您需要核实相关税务问题的真实性。如果确实存在未缴清的税款或滞纳金，您应及时补缴，并向异议人（如税务机关）提供相关的完税证明。这是解决税务异议的关键步骤，也是确保注销流程顺利进行的重要前提。

三、与异议人沟通协商

在核实并处理税务问题后，建议您主动联系异议人（如税务机关），了解其具体的诉求和异议原因。通过沟通，您可以进一步了解异议的详细情况，并尝试提出合理的解决方案。展现您的诚意和合作态度，有助于增进双方的理解和信任。

四、调整注销流程或寻求法律救济

如果税务异议无法在短期内解决，您可能需要考虑调整注销流程。具体来说，您可以终止简易注销程序，并转入一般注销流程。这包括成立清算组、通知公告债权人、进行清算与分配以及最终的注销登记等步骤。

同时，如果您认为税务异议不合理或存在争议，您可以向相关部门（如税务机关或市场监管部门）提出申诉，并提供证据证明异议缺乏事实依据。必要时，您还可以向人民法院提起诉讼或申请仲裁机构仲裁，以维护您的合法权益。

五、总结与预防

在处理完税务异议后，建议您对整个注销流程进行总结和反思。分析导致异议的原因，查找可能存在的漏洞和不足，以便在未来的经营活动中加以改进和避免。

此外，为了预防类似问题的再次发生，建议您在注销前进行全面的自查和风险评估，确保财务状况清晰、无未了结的债务和纠纷，并严格遵守相关法律法规和程序要求。

综上所述，当您在注销公司营业执照时遇到税务异议时，应保持冷静、积极应对。通过明确异议内容与提出主体、核实税务问题并补缴税款、与异议人沟通协商、调整注销流程或寻求法律救济以及总结与预防等步骤，您可以有效地解决税务异议，确保注销流程的顺利进行。