关于“水库淹没区是否缴纳耕地占用税”的问题，首先需要明确的是，耕地占用税的缴纳与否，主要取决于土地的使用性质以及相关的法律法规规定。

结论前置：水库淹没区是否需要缴纳耕地占用税，并非一概而论，而是需要根据具体情况来判断。如果水库淹没区在淹没前属于应税耕地，并且相关税法规定需要缴纳耕地占用税，那么在特定条件下（如新建水库导致耕地被淹没），可能需要缴纳耕地占用税。然而，如果税法有特别规定或者政府有相关政策免除这部分税收，那么则不需要缴纳。

详细分析：

1. 耕地占用税的基本规定：

   • 耕地占用税是对占用耕地建房或者从事其他非农业建设的单位和个人征收的一种特定行为税。
   • 耕地的范围包括种植农作物、林木、牧草、药材及其他农业产品的土地，以及鱼塘、藕池、菜园、果园、苗圃等。

2. 水库淹没区的特殊情况：

   • 水库淹没区在淹没前如果属于应税耕地，那么理论上在耕地被淹没、改变用途（如用于水利设施建设）时，可能需要考虑耕地占用税的缴纳问题。
   • 但实际上，由于水库建设通常属于国家基础设施建设，政府可能会出台相关政策或法规，对这类特殊情况下的耕地占用税进行减免或特殊规定。

3. 法律法规与政策依据：

   • 具体是否需要缴纳耕地占用税，应参考当地的税法规定以及政府发布的相关政策文件。
   • 如果税法或政策中有明确规定水库淹没区不需要缴纳耕地占用税，或者规定了特定的减免条件，那么应遵循这些规定。

4. 建议与咨询：

   • 如果你或你所在的组织面临水库淹没区是否需要缴纳耕地占用税的问题，建议首先查阅当地的税法规定和政策文件，了解具体的税收政策和减免条件。
   • 如果有任何疑问或不确定的地方，可以向我咨询，我会根据你的具体情况提供进一步的法律分析和建议。

综上所述，水库淹没区是否需要缴纳耕地占用税，需要根据当地的税法规定、政策文件以及具体情况来判断。如果有相关疑问或需求，请随时向我咨询。