火车改签手续费的扣除规则主要依据改签时间以及改签前后车票的价格来确定。以下是详细的解释：

一、改签时间对手续费的影响

1. 开车前48小时以上改签

   • 如果改签票面乘车日期及以前的列车，或者改签当日其他列车，不收取改签费。
   • 如果改签车票载明的乘车日期之后的列车，在铁路运输企业有运输能力的前提下，可以免费改签预售期内的列车，不收取改签费；若需核收改签费，则按照改签前后低票价车票票面价格的相应比例计收。

2. 开车前24小时以上、不足48小时改签

   • 改签票面乘车日期之后的列车时，按改签前后低票价车票票面价格的5%核收改签费。

3. 开车前不足24小时改签

   • 改签票面乘车日期之后的列车时，按改签前后低票价车票票面价格的15%核收改签费。

4. 开车后改签

   • 在当日24时之前，可改签车票载明的乘车日期之后预售期内列车，按改签前后低票价车票票面价格的40%核收改签费。
   • 特别注意，改签后的车票如果再次取消旅行，且是开车后改签的车票，则不能退票。

二、改签费用的计算方式

• 改签费用以5角为单位进行计收。
• 尾数小于2.5角的舍去，2.5角（含）以上且小于7.5角的计为5角，7.5角（含）以上的进为1元。

三、其他注意事项

• 一张车票只能办理一次改签。
• 办理变更到站的改签时，应在开车前48小时以上，并且如果原车票已托运行李，还应办理行李变更或取消业务。

综上所述，火车改签手续费的扣除规则是根据改签时间以及改签前后车票的价格来确定的，旅客在改签时应仔细核对相关信息，以避免不必要的费用支出。同时，也建议旅客提前了解铁路部门的改签规定，以便在需要时能够顺利办理改签手续。