法院提交立案申请后，并不意味着立即进入调解程序。是否进行调解，以及调解的时机和方式，都需根据案件的具体性质、当事人的意愿以及法律的相关规定来决定。

首先，从案件性质来看，民事案件，如合同纠纷、侵权纠纷、婚姻家庭纠纷等，因其具有灵活高效、成本低廉的特点，更倾向于通过调解来解决。部分行政案件，特别是涉及行政机关自由裁量权的案件，以及行政赔偿、补偿案件，也存在调解的空间。然而，对于严重刑事案件，如故意杀人、抢劫、强奸等，因涉及社会公共利益和法律秩序维护，一般不进行调解。特别程序、督促程序、公示催告程序等特定案件也不适用调解。

其次，当事人的意愿也是决定是否进行调解的关键因素。调解必须基于双方当事人的自愿，不得有任何强迫。如果一方或双方当事人不同意调解，那么法院将按照正常的诉讼程序进行审理。

最后，法律的规定也影响着调解的进行。法院在立案后，会首先对案件进行审查，包括管辖权、诉讼主体资格、诉讼请求的明确性等。如果案件适合调解且双方当事人同意，法院将组织调解。调解可以在立案后的任何阶段进行，包括庭前调解、庭审中的调解以及判决前的调解。如果调解成功，双方当事人将达成调解协议，该协议具有法律效力，必须履行。如果调解未能达成协议，法院将继续按照诉讼程序审理，并依法作出判决。

综上所述，法院提交立案申请后能否进行调解，需要根据案件的具体性质、当事人的意愿以及法律的相关规定来综合判断。如果条件允许且双方当事人同意，调解可以作为一种高效、灵活的纠纷解决方式来进行。