门诊做磁共振是否可以通过新农合报销，主要取决于您所在的地区以及具体的医保政策。以安徽省为例，根据公开发布的信息，安徽省对于城乡居民基本医疗保险的报销范围及比例有明确规定。

在安徽省内，城乡居民在参保县（区）域内定点基层医疗卫生机构（包括二级乡镇卫生院或社区卫生服务中心等）以及一级及以下定点医疗机构（如村卫生室、社区卫生服务站等）发生的普通门诊医药费用，报销比例通常为55%，且每年有限额，如200元。然而，需要注意的是，普通门诊报销暂不向县（区）域内二级医疗机构延伸。这意味着，如果您在二级或更高级别的医疗机构进行门诊磁共振检查，可能无法直接通过新农合进行报销。

另外，安徽省的医保政策还规定了不同级别医疗机构的报销比例和限额。例如，在镇卫生院就诊的报销比例可能为40%，每次就诊的各项检查费及手术费限额为50元；而在二级医院就诊的报销比例可能为30%，每次就诊的各项检查费及手术费限额也为50元，但处方药费限额可能提高到200元。

为了获得最准确的报销信息，我建议您直接咨询您所在地的医保机构或定点医疗机构，他们可以根据您的具体情况和当地的医保政策为您提供详细的解答。同时，您也可以关注当地的医保公众号或官方网站，以获取最新的医保政策和报销信息。