医院科主任并不直接对应公务员体系中的正科级职位。首先，我们需要明确医院科主任的职位性质与公务员职级序列的区别。

医院科主任是医院内部的管理职务，其级别和职责通常根据医院的规模、性质以及内部管理规定来确定。在医院体系中，科主任负责某一科室的行政管理和业务指导，其职位级别可能因医院的不同而有所差异。

而公务员职级序列则是根据公务员法及相关规定，对公务员的职务与职级进行划分和管理的体系。公务员职级序列包括多个层次，如一级巡视员、二级巡视员、一级调研员、二级调研员等，以及乡科级正职、乡科级副职等基层领导职务。

正科级是公务员职级序列中的一个层次，通常对应着基层领导职务中的乡科级正职。然而，医院科主任并不属于公务员体系，因此其职位并不直接对应正科级或其他公务员职级。

综上所述，医院科主任的职位级别与公务员体系中的正科级职位没有直接对应关系。要确定医院科主任的具体级别和职责，需要参考医院的相关规定和管理制度。