车牌掉漆后自行补漆是违法的。根据相关规定，车牌如果掉漆或损坏，车主不能自行进行修补。因为车牌上原本涂有反光膜，如果车主自行用普通油漆涂料补上，可能会使监控探头无法清晰拍摄到车牌，从而在发生交通事故或其他情况时产生隐患。

进一步来说，根据我国《道路交通安全法》的相关规定，伪造、更改或者使用伪造、变造的机动车牌号，公安机关交通管理部门将予以收缴，扣留机动车，并处以15日以下拘留，以及两千元以上五千元以下罚款。如果构成犯罪，还将依法追究刑事责任。即便车主的初衷只是为了修补掉漆的车牌，而非故意伪造或更改，但自行补漆的行为仍可能被视为涂改号牌，从而面临严厉的处罚。

因此，如果车牌出现掉漆或损坏的情况，车主应该及时前往车管所重新补办车牌。补办过程虽然可能需要一些时间，但相比起因自行补漆而可能面临的处罚来说，这是更为稳妥和合法的选择。在补办车牌时，车主需要准备相关材料，如车辆所有人的身份证原件及复印件、行驶证原件、《机动车牌证申请表》以及污损或损坏的车牌等。提交完材料并缴纳相应费用后，车主可以等待领取新的车牌。在此期间，车主还可以申请临时牌照，以方便正常用车。