脑CT检查是可以报销的。根据公开信息，国家医保局已经明确表示，B超、CT等检查项目全国各省都已纳入医保支付范围。这意味着，符合医保规定的脑CT检查费用，可以通过医保进行报销。

具体来说，如果您是参保职工，在门诊就医时进行的脑CT检查，只要符合医保目录内的规定，且超过了起付线（门槛费），就可以直接通过医保进行报销。报销时，您只需持医保卡或医保电子凭证在定点医疗机构进行就医结算，无需额外申请。医保系统会自动记录您的医疗费用，并在达到起付线后开始报销。

此外，如果您是异地就医的参保人员，也需要注意相关的报销政策。根据内蒙古医保局的异地就医管理规定，参保人员异地就医备案满一定期限并办理取消备案或变更后，在参保地就医时仍可享受当地医保待遇。因此，在进行脑CT检查前，建议您先了解清楚当地的医保政策和报销流程，以确保您的医疗费用能够得到及时、有效的报销。

总的来说，脑CT检查是可以报销的，但具体报销比例和流程可能因地区和医保政策的不同而有所差异。建议您在进行检查前，先咨询当地的医保部门或定点医疗机构，以获取最准确的信息。