新生儿合作医疗登记后的缴费流程，根据您所在地区的不同，可能会有所差异。但一般来说，遵循以下步骤可以完成缴费：

首先，确保您已经完成了新生儿的参保登记。这通常是在新生儿出生后，凭借出生医学证明在定点医院或相关医保经办机构办理的。登记时，您需要填写新生儿的个人信息，如姓名、性别、证件类型、证件号码等，并上传相关证件的原件照片或扫描件。

完成参保登记后，接下来就是通过税务缴费渠道进行缴费。缴费方式通常有多种，包括线上和线下方式。

以线上缴费为例，您可以通过微信搜索并关注当地税务或医保部门的小程序（如“粤税通”、“山东税务社保费缴纳”等），然后按照提示进行实名认证和绑定身份信息。在选择缴费项目时，选择“城乡居民医疗保险”，并输入新生儿的参保信息，如参保地市、险种、缴费类型等。确认无误后，即可进入缴费界面，使用微信支付或银行卡支付完成缴费。

请注意，不同地区的缴费标准和政策可能有所不同，因此在进行缴费前，请务必确认您所在地区的具体政策和流程。此外，新生儿参保后，还需要在规定时间内完成落户和医保参保关键信息的修改业务，以确保新生儿能够享受医保待遇。

如果您在缴费过程中遇到任何问题或疑问，可以及时联系当地医保部门或税务部门进行咨询和寻求帮助。希望这些信息能够帮助到您，祝您和宝宝健康快乐！