根据最新的《中华人民共和国发票管理办法》及相关法律法规，已开具的发票存根联应当保存5年。以下是对此规定的详细解读：

一、发票存根联的保存期限

• 法规依据：根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十九条的规定，开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联，应当保存5年。
• 保存目的：这一规定旨在确保税务稽查能够顺利进行，同时保障财务记录的完整性和可追溯性。

二、发票存根联的销毁规定

• 最新变化：值得注意的是，现行规定已删除了“保存期满需报经税务机关查验后销毁”的条款。这意味着，保存到期的发票存根联，开票人可以依法直接销毁，无需再报经税务机关同意。
• 销毁要求：尽管无需报经税务机关查验，但开票人在销毁发票存根联时，仍应确保销毁过程合法、合规，并保留相关记录以备查。

三、其他相关涉税资料的保存期限

• 账簿、记账凭证等：根据《税收征收管理法实施细则》的相关规定，账簿、记账凭证、报表、完税凭证等其他涉税资料也需要按照一定的期限进行保存。这些资料的最低保存期限一般为10年，但法律、行政法规另有规定的除外。
• 会计档案：此外，根据财政部发布的《会计档案管理办法》，会计凭证、会计账簿等主要会计档案的最低保管期限已延长至30年，其他辅助会计资料的最低保管期限也延长至10年。

四、未按规定保管发票的法律后果

• 法律责任：对于未按照规定设置、保管账簿或者保管记账凭证和有关资料的纳税人或扣缴义务人，税务机关有权责令其限期改正，并可处以罚款。具体罚款金额根据情节轻重而定。

综上所述，已开具的发票存根联应当保存5年，并在保存期满后依法直接销毁。同时，企业和个人还需关注其他涉税资料的保存期限要求，确保所有涉税资料的合法性、真实性和完整性，以避免不必要的法律风险和经济损失。