您好，关于职工住院医保报销需个人承担的部分是否可以从医保卡上扣除的问题，这主要取决于您所在地的医保政策和规定。以深圳市为例，根据深圳市医疗保障局的答复，开通个人账户活化使用功能后，参保人在定点医疗机构医保记账时，个人账户余额确实可以用于支付当次医疗费用中符合规定的自付费用，并且刷卡时会自动从个人账户中扣减。

这意味着，在深圳市，如果您已经开通了个人账户活化使用功能，并且您的医保卡上有足够的余额，那么您住院时医保报销后需个人承担的部分，是可以直接从医保卡上扣除的。

然而，也请注意，医保政策可能因地区而异，因此建议您咨询您所在地的医保部门或相关机构，以了解具体的政策和操作流程。同时，也请确保您的医保卡已经开通了相应的功能，并且有足够的余额来支付个人承担的医疗费用。

总的来说，是否可以从医保卡上扣除个人承担的医疗费用，取决于您所在地的医保政策和规定，以及您的医保卡是否开通了相应的功能并有足够的余额。希望这个回答能够对您有所帮助。