2019年个人所得税的计算涉及多个方面，包括综合所得、经营所得以及专项附加扣除等新税法的引入。以下是一个基于您提供的信息和公开资料的详细解答：

一、综合所得的计算

综合所得包括工资、薪金所得；劳务报酬所得；稿酬所得；特许权使用费所得。这些所得适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。

工资、薪金所得

以李先生为例，他在2019年每月在甲企业取得工资薪金收入16000元，无免税收入，每月缴纳三险一金2500元，并享受子女教育和赡养老人专项附加扣除共计3000元。

1. 预扣预缴：
   • 每月应纳税所得额 = 累计收入 - 累计免税收入 - 累计减除费用 - 累计专项扣除 - 累计专项附加扣除
   • 每月应预扣预缴税额 = 应纳税所得额 × 预扣率 - 速算扣除数

按照上述方法，可以计算出李先生每月的应预扣预缴税额。例如，1月应纳税所得额为5500元（16000-5000-2500-3000），对应税率为3%，应预扣预缴税额为165元。

1. 汇算清缴：
   • 年度收入额 = 工资、薪金所得收入 + 劳务报酬所得收入 + 稿酬所得收入 + 特许权使用费所得收入
   • 综合所得应纳税所得额 = 年度收入额 - 6万元（基本减除费用） - 专项扣除 - 专项附加扣除
   • 应纳税额 = 应纳税所得额 × 税率 - 速算扣除数
   • 年度汇算应补退税额 = 应纳税额 - 预扣预缴税额

根据这些公式，可以计算出李先生全年的应纳税额和应补退税额。

劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得

这些所得也需要按照相应的公式进行预扣预缴和汇算清缴。例如，劳务报酬所得每次收入超过800元的，需要预扣预缴个人所得税；稿酬所得则按每次收入减除800元后的余额的70%作为应纳税所得额。

二、经营所得的计算

经营所得适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率。应纳税所得额是指每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额。

三、专项附加扣除

新税法引入了专项附加扣除项目，包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出。这些都可以在税前进行扣除，以降低纳税人的税负。

四、注意事项

1. 纳税人应确保自己的税务处理符合法律法规的要求，如有疑问，应咨询专业的税务顾问或当地税务机关。
2. 在进行个人所得税计算时，应准确记录各项收入和扣除项目，以便正确计算应纳税额。

综上所述，2019年个人所得税的计算涉及多个方面和复杂的公式。纳税人应仔细了解税法规定，确保自己的税务处理准确无误。