如果银行卡扣费但卡里没钱，一般银行会按照相关规定进行处理，可能包括记录负债、收取滞纳金或利息、限制账户使用等。具体来说：

1. 记录负债：当银行卡余额不足以支付扣费金额时，银行通常会将这笔未能成功扣款的金额记录为用户的负债。用户需要在后续时间内补足这笔欠款。

2. 收取滞纳金或利息：对于未能及时补足欠款的账户，银行可能会根据相关规定收取一定的滞纳金或利息。这些费用会随着时间的推移而累积，增加用户的还款负担。

3. 限制账户使用：如果负债长时间未得到清偿，银行可能会采取进一步措施，如限制账户的使用，包括冻结银行账户、停止提供金融服务等，直到用户还清欠款。

4. 影响信用记录：此外，银行卡长期欠费还可能对用户的信用记录产生负面影响，影响用户未来申请贷款、信用卡等金融服务的成功率。

因此，建议用户在发现银行卡扣费但卡里没钱时，应及时与银行联系，了解具体欠费情况，并尽快补足欠款，以避免可能产生的不利后果。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。