关于您提出的问题，即爷爷奶奶有低保证但分开户后孙子能否申请贫困补助金，这主要取决于具体的政策规定和申请条件。以下是我根据您提供的信息和一般情况给出的详细解答：

首先，贫困补助金或学生资助通常是为了帮助那些家庭经济困难的学生，以确保他们能够顺利完成学业。这类资助的申请条件往往与家庭的经济状况直接相关。

在您的情况下，爷爷奶奶拥有低保证，这通常意味着他们符合当地最低生活保障的资格，家庭经济状况较为困难。然而，由于您与爷爷奶奶已经分开户籍，这一因素可能会影响孙子申请贫困补助金的资格。

具体来说，资助政策往往要求申请人或其直系亲属（如父母）符合特定的经济困难标准。如果孙子的父母并不符合这些标准（例如，他们有足够的经济收入或资产），那么即使爷爷奶奶有低保证，孙子也可能无法直接因此获得贫困补助金。

不过，有些政策可能会考虑到特殊情况，比如家庭中的其他成员（如祖父母）的经济状况对孙子学业产生了直接影响。在这种情况下，您可能需要提供额外的证明材料，如家庭收入证明、爷爷奶奶的低保证明、以及这些经济状况如何具体影响到孙子的学业等。

为了获得最准确的答案，我建议您直接咨询当地的教育部门、学校或相关资助机构。他们可以根据具体的政策规定和您的家庭情况，为您提供更详细的指导和帮助。同时，您也可以关注当地教育部门或学校的官方网站，了解最新的资助政策和申请流程。