选择在哪里进行眼睛手术，实际上取决于多个因素，包括医院的专业水平、医生的经验、设备先进程度、服务质量以及个人需求等。三甲医院和爱尔眼科都有其各自的优势。

三甲医院通常具备较高的医疗水平和综合实力，拥有丰富的临床经验和专业的医疗团队。在眼科领域，三甲医院往往能够提供更全面、更专业的诊疗服务，特别是在处理复杂病例和疑难杂症方面具有较强的优势。此外，三甲医院通常与科研机构有紧密的合作关系，能够不断引进和应用最新的医疗技术和研究成果。

爱尔眼科则是一家知名的专业眼科医疗机构，专注于眼科疾病的诊疗和研究。它在眼科领域具有深厚的专业背景和丰富的临床经验，拥有先进的眼科医疗设备和专业的医疗团队。爱尔眼科在眼科手术方面具有较高的知名度和口碑，特别是在屈光手术、白内障手术等领域具有显著的优势。

因此，在选择手术地点时，您可以根据自己的实际情况和需求进行考虑。如果您希望获得更全面、更专业的诊疗服务，并且希望医院具备较高的综合实力和科研能力，那么三甲医院可能是一个不错的选择。如果您对眼科手术有特定的需求，或者希望获得更专业的眼科医疗服务，那么爱尔眼科也是一个值得考虑的选择。

最终的选择应该基于对您个人情况的全面评估，包括病情、预算、时间等方面的考虑。同时，建议您在选择医院时，可以咨询专业的医生或医疗机构，以获取更详细、更准确的建议和信息。