高速公路分道限速标准违反后是会扣分的。具体来说：

1. 一般情况：根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》的相关规定，驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之二十以上，或者驾驶其他机动车在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之五十以上的，一次记12分。驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十，或者在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速未达到百分之二十的，一次记6分。驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆以外的机动车在高速公路、城市快速路上行驶超过规定时速百分之二十以上未达到百分之五十，或者在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之五十以上的，一次记6分。驾驶校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆以外的机动车在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之十以上未达到百分之二十的，一次记1分。

2. 特殊情况：在某些特殊情况下，如因道路施工、交通事故、恶劣天气等导致的限速标准临时调整，驾驶员需特别注意路边的限速标志，并按照调整后的限速标准行驶。若违反这些临时限速标准，同样会面临扣分的处罚。

综上所述，高速公路分道限速标准是保障道路交通安全的重要措施，驾驶员在行驶过程中应严格遵守。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。