新生儿42天去医院进行检查时，通常应该挂儿科。在一些医院，特别是儿童医院或设有儿科专科的医院，可能会设有专门的新生儿门诊或儿保科，这种情况下可以直接挂新生儿门诊或儿保科。

由于不同的医院科室设置和挂号流程可能有所不同，建议您在前往医院之前，通过医院的官方网站、公众号或电话咨询等方式，了解清楚医院的科室设置和挂号流程。同时，也可以咨询医院的工作人员，他们会根据您的需求为您提供具体的挂号指导。

在挂号时，通常需要提供新生儿的身份证信息（如已办理）或家长的身份证信息，以及相关的就诊资料。请确保您带齐了所有必要的证件和资料，以便顺利挂号和就诊。

最后，由于新生儿42天的检查通常涉及到生长发育评估、疫苗接种等多个方面，建议您提前了解好检查项目和注意事项，以便更好地配合医生的检查和指导。