专门法院与检察院的主要区别在于它们的性质、职能以及相互之间的关系。以下是详细的解释：

一、性质不同

1. 专门法院：是国家的审判机关，依法独立行使审判权，负责审理特定领域或特定类型的案件，如海事法院、知识产权法院等。

2. 检察院：是国家的法律监督机关，同时也是公诉案件的审查起诉机关，负责监督法律的执行和实施，对刑事案件进行审查起诉。

二、职能不同

1. 专门法院：

   • 依法独立行使审判权，对案件进行审理并作出判决或裁定。
   • 负责解决特定领域或特定类型的法律纠纷。

2. 检察院：

   • 对公安机关侦查的案件进行审查，决定是否逮捕、起诉或不起诉。
   • 对自侦案件进行侦查取证，如贪污贿赂、渎职侵权等职务犯罪案件。
   • 对法院的审判活动进行监督，对违法审判提出纠正意见或抗诉。

三、相互关系

1. 监督与被监督关系：检察院有权依法监督法院的审判过程，对法院的违法审判有权提出纠正意见或抗诉，这体现了监督与被监督的关系。

2. 分工协作关系：在刑事公诉案件中，检察院、法院与公安机关三者之间形成了分工协作、互相配合、互相监督的紧密关系，共同推动刑事司法程序的顺利进行。

综上所述，专门法院与检察院在性质、职能以及相互关系上存在着明显的区别。它们各自独立行使职权，又相互协作、相互监督，共同维护着国家的法律秩序和司法公正。如果您对某个具体案件或法律问题有疑问，欢迎随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。