在合同纠纷仲裁案件中，被申请人是可以提起反诉的。

详细分析如下：

1. 反诉的定义与条件：

   • 反诉是指在已开启的仲裁程序中，被申请人以原申请人为被告，向仲裁庭提出与原仲裁请求有牵连且独立的反请求。
   • 提出反诉需满足一定条件，如由被申请人以原申请人为被告提出，反诉请求需与原仲裁请求及争议的法律关系有牵连，且需在仲裁规则规定的期限内提出。

2. 反诉的意义：

   • 反诉旨在维护被申请人的合法权益，通过同一仲裁程序统一解决双方的争议，避免分别处理可能带来的矛盾和不一致。

3. 反诉的提出与审理：

   • 被申请人需在规定期限内，向仲裁庭提交反诉申请书等材料。
   • 仲裁庭会对反诉进行审理，并在裁决中一并处理原仲裁请求与反诉请求。

4. 注意事项：

   • 不同仲裁机构和仲裁规则的反诉程序及要求可能存在差异，当事人在提起反诉前应仔细查阅相关仲裁规则和程序。
   • 当事人在仲裁过程中应严格遵守规则程序，以保障自身权益。

综上所述，合同纠纷仲裁案件中，被申请人有权提起反诉，只要符合仲裁协议约定与仲裁规则规定，且反诉请求与原仲裁请求及争议的法律关系有牵连。如有进一步疑问或需要具体法律建议，请直接向我咨询。