当公司停止经营时，员工的赔偿问题主要依据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规来处理。以下是针对这一问题的详细解答：

一、经济补偿金（N倍工资）

1. 适用条件：

   • 公司因经营困难、破产、解散等原因终止劳动合同。
   • 双方协商一致解除劳动合同。

2. 计算标准：

   • 按员工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的按一年计算；不满六个月的支付半个月工资。
   • 月工资指离职前12个月的平均工资（含奖金、津贴等货币性收入），若高于当地职工月平均工资三倍，则按三倍计算，且补偿年限最高不超过十二年。

3. 示例：

   • 员工工作5年8个月，月工资8000元，则经济补偿金为：\(6 \times 8000 = 48,000\)元。

二、代通知金（“+1”个月工资）

1. 适用条件：

   • 若公司未提前30日书面通知解除合同，需额外支付一个月工资作为代通知金。

2. 金额：

   • 按离职前上一个月的工资标准支付。

三、特殊情形下的赔偿金（2N倍工资）

1. 适用条件：

   • 公司违法解除劳动合同，如未支付补偿金即裁员。

2. 计算方式：

   • 经济补偿金标准的两倍。

3. 示例：

   • 员工工作3年被违法解雇，则赔偿金为：\(2 \times 3 \times \text{月工资}\)。

四、其他应付款项

1. 未结工资：

   • 公司需支付至离职日的全部工资及加班费。

2. 社保与公积金：

   • 公司需足额缴纳至离职当月。

3. 报销款与押金：

   • 公司需返还差旅费、业务垫资及扣押的证件、押金。

五、法律程序与注意事项

1. 协商优先：

   • 建议与公司签订书面协议，明确赔偿金额和支付时间。

2. 劳动仲裁：

   • 若协商未果，员工可在一年内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

3. 强制执行：

   • 胜诉后公司仍不支付，员工可向法院申请强制执行。

六、建议行动步骤

1. 保留证据：

   • 保存劳动合同、工资条、考勤记录等，以备后续可能的劳动纠纷处理。

2. 及时沟通：

   • 与公司HR确认赔偿方案，了解公司停止经营的具体原因和后续安排。

3. 法律咨询：

   • 在处理过程中如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。

七、典型案例参考

• 案例1：某科技公司因资金链断裂关闭，与员工协商后支付N+1补偿金（经济补偿金+代通知金），并结清所有工资及社保。
• 案例2：某工厂未提前通知直接裁员，被判定违法解除，最终支付2N赔偿金。

综上所述，当公司停止经营时，员工的赔偿问题涉及多个方面，包括经济补偿金、代通知金、特殊情形下的赔偿金以及其他应付款项。员工应了解自己的权益，并采取相应的行动步骤来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。