个人与公司签订承包协议的合法性，需根据具体情况分析，但普遍遵循法律对合同主体资质和合同有效性的严格规定。以下是对此问题的全面分析：

1. 合法情况：

   • 一般承包协议：若个人与公司签订的承包协议不涉及需要特定资质的行业或领域（如普通的货物运输、简单的劳务服务等），且双方具备相应的民事行为能力，意思表示真实，合同内容合法且不违反公序良俗，则该承包协议是合法有效的。
   • 特定资质下的合法承包：在某些特殊情况下，即使涉及需要资质的行业，如果个人已经取得了相应的资质证书（如某些特定的技术服务资质），并且在其资质等级许可的业务范围内承揽工程或提供服务，那么个人与公司签订的承包协议也是合法有效的。

2. 不合法情况：

   • 无资质承包：若承包协议涉及需要特定资质的行业（如建筑工程、医疗、法律服务等），而个人未取得相应的资质证书，或者超越其资质等级许可的业务范围承揽工程或提供服务，则该承包协议因违反法律强制性规定而无效。例如，根据《建筑法》的相关规定，承包建筑工程的单位必须持有依法取得的资质证书，并在其资质等级许可的业务范围内承揽工程。个人因不具备企业法人资格和相应资质，通常不能作为建筑工程承包合同的承包方。
   • 非法转包、分包：若个人从公司承包工程后，又非法转包或分包给无资质的其他个人或单位，相关承包合同同样无效。这种行为不仅违反了法律法规的强制性规定，也损害了工程质量和施工安全。

3. 法律后果与建议：

   • 法律后果：若承包协议被认定无效，根据《民法典》的相关规定，因该合同取得的财产应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失；双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
   • 建议：在签订承包协议前，个人应充分了解相关法律法规的要求，确保自己具备签订合同所需的资质和条件。同时，公司也应对承包方的资质进行审查，确保合同的合法性和可行性。若涉及需要特定资质的行业或领域，建议双方寻求专业法律人士的帮助，以确保合同的合法性和有效性，避免后续可能的法律纠纷和经济损失。

总结来说，个人与公司签订承包协议的合法性取决于协议的具体内容、双方的资质条件以及是否符合相关法律法规的要求。在签订协议前，双方应充分了解相关法律法规的规定，并谨慎行事，以确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。