爸爸跟女儿当然可以做亲子鉴定。亲子鉴定是一种通过科学手段来确定亲子关系的方法，它基于遗传学原理，通过比较被鉴定人与可能的父母之间的DNA序列相似度来判断是否存在亲子关系。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
法律角度
法律允许：在我国，亲子鉴定是合法的，且被广泛应用于确认亲子关系、解决家庭纠纷、继承权确认等多个领域。爸爸和女儿作为具有直接血缘关系的亲属，完全有权进行亲子鉴定。
隐私保护：虽然亲子鉴定是合法的，但进行鉴定时也需要尊重和保护相关人员的隐私权。鉴定机构通常会采取严格的保密措施，确保鉴定结果不被泄露给未经授权的第三方。
实际操作角度
鉴定流程：进行亲子鉴定通常需要提供被鉴定人的血液、口腔拭子等生物样本。鉴定机构会对这些样本进行DNA提取和分析，通过比较爸爸和女儿的DNA序列相似度来得出鉴定结果。
鉴定结果：亲子鉴定的结果通常具有高度的准确性，能够明确判断爸爸和女儿之间是否存在亲子关系。如果鉴定结果显示存在亲子关系，那么这一结果在法律上通常具有较高的证明力。
伦理道德角度
家庭关系：虽然亲子鉴定在法律上是允许的，但在进行鉴定时也需要考虑家庭关系的影响。如果鉴定结果与家庭成员的期望不符，可能会对家庭关系造成一定的冲击。因此，在进行亲子鉴定前，建议家庭成员之间进行充分的沟通和协商。
尊重意愿：如果女儿已经成年且具备完全民事行为能力，那么在进行亲子鉴定时应该尊重她的意愿。如果女儿不同意进行鉴定，那么爸爸不能强迫她进行。
特殊情况考虑
法律纠纷：如果爸爸和女儿之间存在法律纠纷，如继承权确认、抚养费支付等，且这些纠纷与亲子关系有关，那么进行亲子鉴定可能是一个解决纠纷的有效途径。
医学需要：在某些特殊情况下，如女儿需要接受器官移植等手术，且爸爸是潜在的供体时，进行亲子鉴定可以确认供体与受体之间的生物学关系，从而确保手术的安全性和有效性。
总结与建议：
爸爸跟女儿完全可以做亲子鉴定，且这一行为在法律上是允许的。在进行鉴定时，需要尊重和保护相关人员的隐私权，并考虑家庭关系的影响。如果女儿已经成年且具备完全民事行为能力，那么应该尊重她的意愿。如果在进行亲子鉴定过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。