结论前置：旷工扣三天工资是否违法，需根据具体情况来判断。一般来说，如果用人单位没有合法且合理的规章制度作为依据，直接扣除三天工资通常是不合法的；但如果规章制度明确、合法且经过了公示或员工同意，并遵循了法律规定的扣除限额，则可能合法。

详细分析：

1. 法律规定角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，用人单位不能随意扣除劳动者的工资，除非有明确的法律依据或合同约定。
   • 《工资支付暂行规定》第十六条也规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这一规定限制了用人单位扣除工资的额度和条件。

2. 规章制度与劳动合同方面：

   • 用人单位在劳动合同或规章制度中规定旷工扣三天工资时，该条款必须满足合法性要求。即，规章制度需要经过民主程序制定（如与工会或职工代表平等协商确定），并向劳动者明确公示告知。如果规章制度未经这些程序，或内容违反法律规定，那么该条款对劳动者不具有法律效力。
   • 即使规章制度合法且经过了公示或员工同意，扣除工资的方式也必须合理。直接扣除三天工资往往超出了合理范围，特别是当劳动者仅旷工一天时，这种扣除方式可能被视为对劳动者权益的侵害。

3. 经济损失与赔偿方面：

   • 如果劳动者旷工的行为确实给用人单位造成了实际经济损失，用人单位可以要求劳动者赔偿损失。但这种赔偿应当基于实际损失的合理计算，并提供相应的证据支持。
   • 扣除工资作为赔偿方式时，必须遵循法律规定的扣除限额和条件。即，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

4. 合法合理的处理方式：

   • 对于劳动者的旷工行为，用人单位应当依据公司的规章制度或劳动合同约定进行处理。处理方式可以包括给予警告、记过、扣减绩效考核分数、扣减奖金等，但这些处理方式都应当在合法、合理、公正的范围内进行。
   • 如果用人单位想要通过扣除工资的方式来惩戒旷工行为，应当确保扣除的工资额度合理，并且符合法律规定的条件。

建议与行动指南：

• 对于劳动者：如果遇到用人单位以旷工为由扣三天工资的情况，应先查看用人单位的规章制度或劳动合同中是否有相关规定，并评估其合法性。如果认为自身权益受到侵害，可以与用人单位协商解决；协商不成时，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
• 对于用人单位：在制定规章制度或劳动合同时，应确保相关规定符合法律法规的要求，避免侵犯劳动者的合法权益。同时，在执行过程中也要严格遵守相关规定，确保公平、公正地对待每一位劳动者。如果确实需要扣除工资作为惩戒或赔偿方式，应当确保扣除的额度合理且符合法律规定的条件。

综上所述，旷工扣三天工资是否违法并非一概而论，而是需要根据具体情况进行综合分析。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。